研究团队用缓冲卢戈氏碘液做对比增强显微 CT（µCT）和同步辐射传播相衬 CT，扫描了 57 枚中部鬃狮蜥（Pogona vitticeps）胚胎，分别在 28 ℃ 和 36 ℃ 下孵化，比较 ZW 雌性、ZZ 雄性和高温诱导的 ZZ 性反转雌性的脑发育。重建图像导入 Dragonfly 3D World（Comet Technologies Canada）判读发育分期，并用 Dragonfly 的 Segmentation 菜单把全脑和端脑从其他组织中分割出来；网格在 MeshLab 清理平滑后再导回 Dragonfly 自动读取各对象体积。结果显示 ZZ 基因型个体的端脑显著大于 ZW 雌性，而孵化温度虽影响生长速度和体型，对整体脑大小没有显著影响。所有 CT 数据连同 Dragonfly 格式的扫描与分割文件已在 FigShare 公开。

西班牙 Biogipuzkoa 健康研究所和巴斯克大学等团队构建了刚度匹配的 GelMA 和海藻酸盐三维水凝胶，把基质刚度与黏附性、可降解性分开，研究它们对乳腺癌细胞休眠的影响。共聚焦 z-stack 图像在 Dragonfly 2025.1（Comet Technologies Canada）中做三维重建和分析，用 Segmentation Wizard 以人工标注的 2D 帧训练 U-Net 模型，区分肿瘤团块与单细胞并量化体积和球形度。结果显示黏附、可降解的基质支持增殖性肿瘤团块，惰性基质则促使单细胞休眠：软基质对应 SOX9 相关的短暂类干细胞休眠，硬基质对应 NR2F1 相关的长期休眠；从软基质取出的细胞在鸡胚绒毛尿囊膜中仍不成瘤，患者来源细胞也表现出类似休眠和耐药。

马普生物物理研究所、保罗·埃利希研究所、柏林 FMP 和夏里特医学院等团队结合冷冻电子断层、深度学习颗粒挑选、子断层平均、交联质谱和 AlphaFold3 建模，解析了痘病毒核心上长期寻找的孔道：它由病毒蛋白 E8、E6 和 L3 组成中空六聚管，贯穿核心壁和表面栅栏层，通道内的棒状密度与病毒 RNA 解旋酶 I8 一致，可能参与新合成 mRNA 的释放。论文中训练 3D U-Net 分割栅栏层时，预测结果在 cryoCAT 处理后在 Dragonfly 中人工修正作为第二轮训练的真值，最终所有预测掩膜也都在 Dragonfly 中逐一检查和修正（引用 ORS 2018 年 Dragonfly 深度学习平台论文）。

研究对象是荷兰 Zevenaar 的膨胀黏土，在受控条件下施加干湿循环，测量膨胀压力、体积变化和孔隙结构演变。结果显示一维膨胀压力约为吸力的 24%，与干湿历史、试验类型和施加应力无关；收缩和膨胀基本可逆，没有累积永久变形。样品在 CoreTOM 显微 CT 上于天然状态和各干湿阶段末扫描，孔隙分析在 Dragonfly 3D World（Comet Technologies Canada）中完成，通过图像阈值把孔隙与固体基质分开，统计孔隙率和孔隙体积分布；μCT 显示随循环次数增加微孔数量和中孔体积上升，提示孔隙逐步重排、更易开裂。

澳大利亚科廷大学团队用响应面法优化牛肉脆片的牛肉粉添加量、挤出片厚度和烘烤时间，得到牛肉粉 65.8%–67.7%、烘烤 14.0–14.8 分钟、片厚 1.0 mm 的最优配方，优化后脆度可接受度 67.5 ± 1.3，高于未优化配方的 60.8 ± 3.3。作为优化后的验证，样品在 Zeiss Versa XRM-500 上以 4 µm 像素扫描，2D 截面和 3D 重建图像用 Dragonfly 3D World 2024.1（Comet Technologies Canada）生成，并用 Otsu 法自动做孔隙分割。显微 CT 显示最优牛肉脆片的孔更小、连通性更好，孔隙连通性更接近商品薯片。

研究开发了多功能复合磁性颗粒 F-Fe₃O₄，并与静磁场联合用于感染性骨缺损。体外实验中它对人骨髓间充质干细胞生物相容性好，促进增殖、迁移和成骨分化，并抑制大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和粪肠球菌，加静磁场后效果进一步增强；在大鼠感染性股骨缺损模型（经北京大学生物医学伦理委员会批准）中，联合治疗减轻早期感染和炎症、加快新骨形成，机制上与 SLC2A1 介导的葡萄糖摄取及 HIF-1、PI3K/AKT 通路激活有关。术后 4 周和 8 周的骨样本用 NanoVoxel-1000 显微 CT 扫描，Dragonfly 软件（Comet Technologies, Canada）用于图像重建和分析，计算 BV/TV、Tb.N 等骨形态参数。